Tout d'abord merci de nous avoir eclaicir. Mon problème a moi est que pour un individu j'ai des données sur plusieurs période, donc j'ai besoin de savoir comment modeliser ce cas de figure j'aimerais entré en contact avec toi si il y a un moyen
Bonjour, merci pour votre retour. Depuis 2 ans, j'occupe un poste qui ne nécessite plus de biostatistique, donc, pour répondre à votre question, il faudra que je fasses de la recherche que je n'aurais pas le temps de faire. Ainsi, merci de chercher sur UA-cam, tu trouveras des tutos plus ciblés, j'espère.
Merci pour tout cher aîné. Pourrais je avoir les syntaxes que vous avez présente pour Régression de Cox et analyse de survie sur R? Je fais bien l'exercice dans Spss mais je voudrais l'apprendre aussi dans R, ou cela semble plus flexible.
Merci beaucoup pour la vidéo, c'était vraiment très bien ! J'ai une petite question : Sur ma base coxph donne : Likelihood ratio test= 5.01 on 1 df, p=0.03 Wald test = 5.99 on 1 df, p=0.01 Score (logrank) test = 7.22 on 1 df, p=0.007 Comment savoir lequel de ces 3 résultats prendre ? 2e question : est-ce qu'on peut utiliser le modèle de Cox pour des variables catégorielles mais non binaires (par ex 4 traitements différents), ou est-ce qu'on doit utiliser le log rank comme dans la vidéo d'avant ? Merci d'avance !
Bonjour, pour répondre à votre question, il faudra que je révise car je ne travaille plus en épidémiologie /bio statistiques depuis 2 ans, merci pour votre compréhension. Je travaille actuellement en recherche et je ne fais plus de statistiques. Mais j’ai noté votre question et je vous répondrai quand j’aurais le temps.
Bonjour, Merci pour cette vidéo très bien expliquée! J'aurais cependant une question: à quoi correspondent se(coef), z et Pr(>|z|) dans le resultat de coxph svp?
Je vous en prie. se(coef) signifie « standard error of coefficient », c’est l’erreur type du coefficient. Pr(>|z|), c’est la p-valeur. Généralement, les résultats de la régression multiples vous donnent sur R: les coeffitients (les pentes), leurs erreurs-types, et les p-valeurs de la statistique z des tests des pentes.
Svp est ce que si on a deux modeles decox , le premier est ajuste avec d autre variable et le deuxieme non , ils vont avoir des fonctions de survis differentes ? Si oui comment je peux tracer une fonction de survie d un model ajuste sur d autre variables .
Bonjour, oui, la fonction de suivi du modèle ajustée sera différente de celle non ajustée. Et après, la fonction sera tracée de la même manière que celle du modèle non ajusté. C’est vrai que, y a une manière de tracer les 2 courbes sur les mêmes axes que je ne connais pas, mais je vais chercher quand j’aurais le temps. Sinon, vous pouvez exécuter le code par(mfrow = c(1, 2)), suivi par les codes des deux fonctions afin d’avoir les graphiques de deux fonctions côte à côte sur le même plan.
@@adilalatrech Je vous en prie. Si vous voulez avoir les 2 modèles, il faut faudra d’abord les nommés différemment. Par exemple, modele et modele_ajuste. Au modele_ajuste, il suffit juste d’écrire +le nom du facteur d’ajustement. Soit, y=x1+2, y ajustée par x2 sera par exemple y_ajuste=x1+2+x2.
@@minukuututorials en faite moi je travail avec python et la fonction de survie generer par le modele de kplanmeir qui me demande dans les parametres juste time to event et event observed , je peux la tracer sans le model de kplan meir ?
Bonjour cher frère, merci pour vos explications très claires. Pouvez-vous m'envoyer le script R de cette partie et de celui que vous aviez fait pour Kaplan Meier s'il-vous-plaît ? Merci d'avance 🙏!!!
Bonsoir, c'est étrange pour moi. Je vais chercher la solution. Si je trouve quelque chose intéressante je vais partager avec vous. Le fichier que vous voulez importer est au quel format svp?
Bonjour, tu peux utiliser une calculatrice. Ce sont des logarithmes un peu difficile à calculer manuellement. Sinon regardes sur l'internet il y'aura des calculatrices visuelles pour faire ça.
Le facteur d'exposition peut être un médicament ou autre intervention thérapeutique comme ça peut aussi être un risque (hazard) environnemental etc. C'est par le test de Logrank qu'on peut juger si l'effet d'exposition au facteur est statistiquement significatif ou pas. Le test de Logrank compare la distribution de la survie des deux groupes (exemple groupe anyant reçu traitement A et groupe ayant reçu traitement B ou par exemple groupe exposé à un polluant et groupe non exposé au polluant) visualisée par les courbes de Kaplan Meier et nous donne un p-valeur pour interpréter. Si l'effet est significatif la p-valeur sera inférieur à 0,05
Grâce à tes vidéos, j'avance dans mes analyses. Merci frangin
Avec plasir. Je suis très content de savoir que ça t'a aidé. L'essentiel c'est ça. Mon objectif est atteint.
mercii pour la video
Avec plaisir, frère
thanks you man
You are most welcome :)
Tout d'abord merci de nous avoir eclaicir. Mon problème a moi est que pour un individu j'ai des données sur plusieurs période, donc j'ai besoin de savoir comment modeliser ce cas de figure j'aimerais entré en contact avec toi si il y a un moyen
Bonjour, merci pour votre retour. Depuis 2 ans, j'occupe un poste qui ne nécessite plus de biostatistique, donc, pour répondre à votre question, il faudra que je fasses de la recherche que je n'aurais pas le temps de faire. Ainsi, merci de chercher sur UA-cam, tu trouveras des tutos plus ciblés, j'espère.
Bonsoir merci beaucoup pour la vidéo , j'aimerai savoir est-ce que c'est possible d'avoir les syntaxes des deux modèles de l'analyse de survie
Bonsoir, malheureusement, je n’ai plus les syntaxes car j’ai eu un problème avec mon pc à un moment donné et j’avais tout perdu.
Merci beaucoup pour la vidéo. avez vous une vidéo sur les Modèles à temps de vie accélérée AFT et PH? Merci d'avance
Je vous en prie. Je n'ai pas de vidéo sur les modèles à temps de vie accélérée mais je vais la faire quand j'aurai le temps.
Merci pour tout cher aîné. Pourrais je avoir les syntaxes que vous avez présente pour Régression de Cox et analyse de survie sur R? Je fais bien l'exercice dans Spss mais je voudrais l'apprendre aussi dans R, ou cela semble plus flexible.
Avec plaisir frère. Je viens de vous envoyer le script par mail :)
Merci beaucoup pour la vidéo, c'était vraiment très bien !
J'ai une petite question :
Sur ma base coxph donne :
Likelihood ratio test= 5.01 on 1 df, p=0.03
Wald test = 5.99 on 1 df, p=0.01
Score (logrank) test = 7.22 on 1 df, p=0.007
Comment savoir lequel de ces 3 résultats prendre ?
2e question : est-ce qu'on peut utiliser le modèle de Cox pour des variables catégorielles mais non binaires (par ex 4 traitements différents), ou est-ce qu'on doit utiliser le log rank comme dans la vidéo d'avant ?
Merci d'avance !
Bonjour, pour répondre à votre question, il faudra que je révise car je ne travaille plus en épidémiologie /bio statistiques depuis 2 ans, merci pour votre compréhension. Je travaille actuellement en recherche et je ne fais plus de statistiques. Mais j’ai noté votre question et je vous répondrai quand j’aurais le temps.
@@minukuututorials Ok, merci beaucoup ! bon courage
@@Amina-b3k Je vous en prie. Bon courage également ❤️🩹
Bonjour,
Merci pour cette vidéo très bien expliquée! J'aurais cependant une question: à quoi correspondent se(coef), z et Pr(>|z|) dans le resultat de coxph svp?
Je vous en prie. se(coef) signifie « standard error of coefficient », c’est l’erreur type du coefficient. Pr(>|z|), c’est la p-valeur. Généralement, les résultats de la régression multiples vous donnent sur R: les coeffitients (les pentes), leurs erreurs-types, et les p-valeurs de la statistique z des tests des pentes.
@@minukuututorials Ah très bien ! Merci beaucoup !
@@john-johnlutula1081 Avec plaisir
Svp est ce que si on a deux modeles decox , le premier est ajuste avec d autre variable et le deuxieme non , ils vont avoir des fonctions de survis differentes ? Si oui comment je peux tracer une fonction de survie d un model ajuste sur d autre variables .
Bonjour, oui, la fonction de suivi du modèle ajustée sera différente de celle non ajustée. Et après, la fonction sera tracée de la même manière que celle du modèle non ajusté. C’est vrai que, y a une manière de tracer les 2 courbes sur les mêmes axes que je ne connais pas, mais je vais chercher quand j’aurais le temps. Sinon, vous pouvez exécuter le code par(mfrow = c(1, 2)), suivi par les codes des deux fonctions afin d’avoir les graphiques de deux fonctions côte à côte sur le même plan.
@@minukuututorials merci beaucoup pour votre reponce ، ou est ce que je peux rajouté ces facteurs dans la fonction de survie
@@adilalatrech Je vous en prie. Si vous voulez avoir les 2 modèles, il faut faudra d’abord les nommés différemment. Par exemple, modele et modele_ajuste. Au modele_ajuste, il suffit juste d’écrire +le nom du facteur d’ajustement. Soit, y=x1+2, y ajustée par x2 sera par exemple y_ajuste=x1+2+x2.
@@minukuututorials en faite moi je travail avec python et la fonction de survie generer par le modele de kplanmeir qui me demande dans les parametres juste time to event et event observed , je peux la tracer sans le model de kplan meir ?
@@adilalatrech Malheureusement, je ne connais python, donc je ne pourrais pas vous. C’est un logiciel que j’aimerais apprendre quand même.
Bonjour cher frère, merci pour vos explications très claires. Pouvez-vous m'envoyer le script R de cette partie et de celui que vous aviez fait pour Kaplan Meier s'il-vous-plaît ?
Merci d'avance 🙏!!!
Je vous en prie, mon frère. Pouvez-vous me communiquer votre adresse mail pour vous envoyer le script svp?
Sinon, envoyez-moi un mail à miukuututorials@gmail.com
Bonjour Miniku.
En important mes données sur R ça me marque impossible permission denied. Puis je savoir ce que je dois faire ?
Bonsoir, c'est étrange pour moi. Je vais chercher la solution. Si je trouve quelque chose intéressante je vais partager avec vous. Le fichier que vous voulez importer est au quel format svp?
@@minukuututorials format csv
@@toeange6531 D’accord, je vais chercher. Merci
@@minukuututorials le problème est résolu..
Dans le modèle de Cox lorsque tous les individus sont suivis jusqu à la mort d eux tous, est ce que une colonne statut est nécessaire?
bonjour frangin.
j'ai une question. on sait que le HR = exp(bêta).
comment calculer HR = expo(5 bêta)?.
merci
Bonjour, tu peux utiliser une calculatrice. Ce sont des logarithmes un peu difficile à calculer manuellement. Sinon regardes sur l'internet il y'aura des calculatrices visuelles pour faire ça.
@@minukuututorials si nous avons plusieurs résultats de HR, ça sera difficile de calculer un à un
Vas sur ce site:
www.solumaths.com/fr/calculatrice-en-ligne/calculer/exp
@@amena.6112 Je pense normalement R te donne automatiquement le HR. Regarde bien.
@@minukuututorials effectivement, R donne pour 1bêta. mais pour calculer 5 bêta, 10 bêta , quel script utiliser ?
Comment peut on juger si un facteur a un effet significatif ou pas sur le hasard ?
Le facteur d'exposition peut être un médicament ou autre intervention thérapeutique comme ça peut aussi être un risque (hazard) environnemental etc. C'est par le test de Logrank qu'on peut juger si l'effet d'exposition au facteur est statistiquement significatif ou pas. Le test de Logrank compare la distribution de la survie des deux groupes (exemple groupe anyant reçu traitement A et groupe ayant reçu traitement B ou par exemple groupe exposé à un polluant et groupe non exposé au polluant) visualisée par les courbes de Kaplan Meier et nous donne un p-valeur pour interpréter. Si l'effet est significatif la p-valeur sera inférieur à 0,05
Je cherche une base de données
D’accord, malheureusement, je n’ai plus cette base de données. J’ai eu un problème avec mon PC un moment donné et je l’ai perdu
le se(coef) signifie quoi?
Je n'ai pas compris. Veuillez écrire la commande complète comme ça j'aurais une idée. Merci
@@minukuututorials dans la sortie du modèle, il y a le "se(coef)", qui est à côté de exp(coef) : il s'agit de quoi?
@@amena.6112 C'est l'erreur-type (standard error) du coefficient.