Chemistry with Python - an Introduction to RDKit

Поділитися
Вставка
  • Опубліковано 31 січ 2025

КОМЕНТАРІ • 58

  • @Stelo555
    @Stelo555 3 роки тому +15

    Thank you for this nice little tutorial. I'm a chemist and just started to get more into cheminformatics ... watching your video was a great start. I would love to see more like that. :-)

  • @askhataubakirov9370
    @askhataubakirov9370 2 роки тому

    Thank you for the very descriptive and useful introduction! Please keep it going - I would be happy to see more

  • @Bunnybobscodes
    @Bunnybobscodes Рік тому

    I was not aware of the RDKit tooling this is really helpful!

  • @khinchang7628
    @khinchang7628 2 роки тому +1

    Hi. I am learning Conputational chemistry. I hope you will post more videos related to chemistry. Thank you so much for your tutorial.

  • @ErickR-o5c
    @ErickR-o5c Рік тому

    I m from Brasil, well done machine learning

  • @maihoa9032
    @maihoa9032 2 роки тому

    I hope you will upload a lot of videos realted to Chemistry in the future. I am studying computation chemistry. I am using python

  • @scienceaddicted3431
    @scienceaddicted3431 3 роки тому

    Great video! It's a topic I also intend to tackle on my channel. Thank you for your work! 👍

  • @70shahin
    @70shahin 3 роки тому

    I totally needed that.
    thanks

  • @balajeeramachandran2141
    @balajeeramachandran2141 Рік тому +5

    great intro tutorial learning how to import from online databank but the background music is horrible. Easily getting diverted.

  • @piergiorgiocianciullo6784
    @piergiorgiocianciullo6784 8 місяців тому

    Super! 👏🏻

  • @jackq2331
    @jackq2331 7 місяців тому

    Great course.

  • @alice920124
    @alice920124 2 роки тому +2

    HI! I appreciate your great effort in introducing a tutorial of RDKit. Would it be possible to perform quantum computational studies such as calculation of Fermi energy?

  • @debanjansen1282
    @debanjansen1282 3 роки тому +2

    Haloo, I have 1milion compounds retrieved from chembl dB. I want to build 3D mol2 structures from each smales and calculate as much as descriptors calculation for ML model. How to do that with RDkit?

  • @taosun8549
    @taosun8549 3 роки тому +1

    Thanks, great video. I have learned a bit Rdkit as well, but I am not sure if we could use it to analyze the reaction mechanism, like how cool it would be if we could generate an electron pushing arrow image automatically.

  • @DrWillWood
    @DrWillWood 3 роки тому +1

    Great tutorial, thank you!

  • @irumnaz8498
    @irumnaz8498 Місяць тому

    Hello sir
    I am Ph.D in physical chemistry .How will I learn quickly python.

  • @irumnaz8498
    @irumnaz8498 Місяць тому

    Hello Sir,
    How can I simulate NiO @ZnO

  • @jestinpjiji260
    @jestinpjiji260 3 роки тому +1

    Hey is there any function in Rdkit which can convert the smiles text into the corresponding IUPAC Name or compound name
    for eg: we know that 'C' is the smiles format of methane so is there any function to which we provide smiles as an input and provide u Methane as an output

  • @satyarahul8007
    @satyarahul8007 2 роки тому

    Hello , i an excel sheet of compounds and i need to find the aromatic rings in the compound by iterating through compunds. But what is condition to find aromatic rings.

  • @faridehabdollahi1703
    @faridehabdollahi1703 3 роки тому

    Hi,
    Thanks for your useful tutorial.
    Can you please tell me are there any methods for converting a list of molecules to their smiles code with RDKit package and how?
    Thanks

    • @aminaghamohamadi1165
      @aminaghamohamadi1165 2 роки тому

      I believe you can use a pandas library and the function Chem.MolToCXSmiles from RDKit to achieve that.

  • @petelok9969
    @petelok9969 3 роки тому

    Hi Bernard, nice tutorial. I'm getting an import error when I run 'from rdkit import chem' jupyter can see the path but just can't do it.

  • @hyejihwang1490
    @hyejihwang1490 3 роки тому

    thank you!!!

  • @kirk0831
    @kirk0831 3 роки тому

    Great. Can you do how rk do chemical enumeration?

  • @ramachava1293
    @ramachava1293 2 роки тому

    Hello sir
    I'm a PG (organic chemistry) student. Could you please. Tell me some chemistry related IT courses.
    Thank you
    And thank you for video

  • @GregoryBenitez-p8w
    @GregoryBenitez-p8w 4 місяці тому

    Juanita Spring

  • @RonaldRobinson-h8o
    @RonaldRobinson-h8o 4 місяці тому

    Hackett Inlet

  • @NellySigrid-i9x
    @NellySigrid-i9x 4 місяці тому

    Dedric Row

  • @ElectionsOrgansArkham-q5s
    @ElectionsOrgansArkham-q5s 4 місяці тому

    Charles Estates

  • @BrightMatthew-t9q
    @BrightMatthew-t9q 4 місяці тому

    O'Reilly Crest

  • @JoanLevy-k1f
    @JoanLevy-k1f 4 місяці тому

    Mylene Neck

  • @PaulaLovell-g1k
    @PaulaLovell-g1k 5 місяців тому

    Delbert Courts

  • @AnneLarry-b3y
    @AnneLarry-b3y 4 місяці тому

    Harvey Ridges

  • @HughesNick-c5w
    @HughesNick-c5w 4 місяці тому

    Blaise Greens

  • @GiseleHowland-e8u
    @GiseleHowland-e8u 4 місяці тому

    Lurline Forge

  • @ErnestAnderson-j3i
    @ErnestAnderson-j3i 3 місяці тому

    Benedict Forest

  • @TheresaDempsey-w6b
    @TheresaDempsey-w6b 4 місяці тому

    Libbie Street

  • @MarshallArmstrong-y6r
    @MarshallArmstrong-y6r 4 місяці тому

    Raynor Park

  • @PriestleyBeck-j6z
    @PriestleyBeck-j6z 4 місяці тому

    Muller Hill

  • @JamesPrima-m6q
    @JamesPrima-m6q 4 місяці тому

    Santos Mountain

  • @SoledadWojdak-c8r
    @SoledadWojdak-c8r 4 місяці тому

    Lockman Knoll

  • @BnmSdf-w1c
    @BnmSdf-w1c 4 місяці тому

    Quigley Lake

  • @EzekielBunyan-i5o
    @EzekielBunyan-i5o 4 місяці тому

    Kautzer Alley

  • @FrankSmith-n6v
    @FrankSmith-n6v 4 місяці тому

    Volkman Forks

  • @KareemSwaine-o9o
    @KareemSwaine-o9o 4 місяці тому

    Streich Stravenue

  • @AliceBrown-d5d
    @AliceBrown-d5d 4 місяці тому

    Schinner Junction

  • @MatthewHathaway-h7b
    @MatthewHathaway-h7b 5 місяців тому

    Powlowski Mountain

  • @ClarkeJosephine-u2e
    @ClarkeJosephine-u2e 3 місяці тому

    Hilpert Hollow

  • @IV.Kerwin-f4n
    @IV.Kerwin-f4n 4 місяці тому

    Abernathy Summit

  • @SadieByrd-b3o
    @SadieByrd-b3o 4 місяці тому

    Koch Ford

  • @crimson4066
    @crimson4066 3 роки тому +1

    No music necessary

  • @JosephBowen-f4s
    @JosephBowen-f4s 4 місяці тому

    Marjorie Brook

  • @AngelaMiller-q8n
    @AngelaMiller-q8n 4 місяці тому

    Verner Neck

  • @GeorgeOkins-t6h
    @GeorgeOkins-t6h 4 місяці тому

    Fae Villages

  • @DoYouHaveAName1
    @DoYouHaveAName1 29 днів тому

    Thank you :D

  • @ayaalaa6261
    @ayaalaa6261 2 роки тому

    thank you!

  • @NinaTimmons-y1g
    @NinaTimmons-y1g 4 місяці тому

    Zboncak Light