Ο Ζαχαρίας Σπυριδάκης γεννήθηκε στην Αθήνα το 1971 από γονείς Κρητικούς. Με την κρητική λύρα ασχολείται από το 1980. Από το 1983 μαθητεύει κοντά στον λυράρη και δάσκαλο της κρητικής μουσικής Κώστα Μουντάκη.
Το 1989 λαμβάνει από το Ελληνικό Ωδείο της Αθήνας το πρώτο πτυχίο, που του παραδίδει ο Κώστας Μουντάκης με βαθμό άριστα παμψηφεί. Δίδαξε στο τμήμα κρητικής λύρας του Ελληνικού Ωδείου, στη θέση του δασκάλου του, που πέθανε τον Ιανουάριο του 1991. Τα τελευταία χρόνια δίδαξε στο Ελληνικό ωδείο, ωδείο Αθηνών, στο Πανεπιστημιακό Τμήμα Λαϊκής και Παραδοσιακής Μουσικής, στο Παγκύπριο Μουσικό Λύκειο και στο Μουσικό Γυμνάσιο - Λύκειο Παλλήνης, ενώ για πάνω από 15 χρόνια είναι κύριος συνεργάτης στο Μουσικό Εργαστήρι «Λαβύρινθος».
Έχει δώσει συναυλίες τόσο στην Ελλάδα όσο και στο εξωτερικό,
ενώ έχει παρουσιαστεί σε πολλές ραδιοφωνικές και τηλεοπτικές εκπομπές που αφορούσαν στην κρητική παραδοσιακή μουσική.